Les primeres notícies que ens han arribat del temple parroquial de Sant Pere daten de l'any 986. L'any 1676 la vila fou ocupada per tropes franceses i tretze anys més tard ho van fer les tropes espanyoles. Durant aquesta etapa bèl·lica el poble va patir nombrosos desperfectes, entre ells el temple, que es va haver de reconstruir. 

Per a construir aquest temple del segle XVIII es van aprofitar gran part dels murs nord i sud del temple romànic i part del mur est, on ara hi ha la porta d'entrada.  En el mur nord encara es poden veure una porta adovellada de mig punt i unes grans finestres, totes elles cegades.

En el mur sud es repeteixen els mateixos elements, si bé les finestres resten amagades per la vegetació.

En l'interior del temple es conservava una talla de la Verge Maria, que a principis del segle XX, sembla que fou venuda a un antiquari. Des d'aquell moment se li va perdre la pista i actualment es desconeix quina és la seva situació. També es conservava una pica d'aigua beneita, del segle XII,que actualment es troba en el Museu de Banyoles.