El templo actual fecha del siglo XII, cuando la cuenta de Empúries, Ponç Hug II, dio la iglesia a los templers. 

La iglesia está formada por una sola nave acabada en un ábside semicircular y cubierta con una vuelta apuntada. El ábside está construido con sillares muy bien cortados, mientras que al resto del templo son más irregulares. 

En el muro oeste encontramos la puerta de acceso al templo. Está formada por tres arcos en gradación, tímpano y dintel. A su encima hay una ventana de doble derrame y dos arcos degradados. Corona la fachada un campanario de cadireta de dos ojos. 

Adosada al muro sur se encuentra actualmente la vicaría. En este espacio había existido un pequeño claustro. De él sólo quedan seis capiteles y fragmentos de columnas repartidos entre el templo y la vicaría. Están decorados con motivos vegetales y geométricos. En el Museo de Arte de Girona podemos encontrar tres más, en este caso con bestias monstruosas esculpidas. 

También se ha conservado una puerta, hoy cegada, en la que hay una piedra con la cruz de Malta esculpida. 

En el interior del templo se conserva el sepulcro que mandó construir la cuenta de Empúries Ponç Hug II. 

En los siglos XVII y XVIII se añadieron dos capillas laterales.