Les primeres notícies del lloc de Villa Mucroni daten de l'any 974, quan segons una butlla del papa Benet VI, el monestir de Sant Pere de Rodes tenia un alou a la zona.  El temple no apareixerà en cap document fins l'any 1116, moment en que va ser donada pel bisbe Berenguer Dalmau a la seu gironina.

L'església actual es va construir en el segle XVIII, tal i com ens indica la data de 1791 gravada a la llinda de la porta de ponent.

Es tracta d'un temple d'una sola nau, capçada a l'est amb un absis poligonal i amb capelles laterals. Precisament per construir les capelles del costat sud es va aprofitar part de l'estructura del temple romànic, En alguns fragments d'aquest mur i del de ponent, sota l'arrebossat, es conserven filades en opus spicatum, que segurament formaven part del temple del segle X. Aquesta primitiva església va ser posteriorment reformada, com ho demostra la finestra, de doble esqueixada i actualment cegada, que es va obrir en el mur sud.

També es creu que podria ser del temple primitiu la porta, parcialment cegada, que hi ha sota la torre campanar, en el mur sud. Encara es pot veure l'arc de mig punt, amb els muntants lleugerament avançats.

No seria d'estranyar que la finestra que hi ha en el mur oest, junt a la porta d'entrada i que ha estat descoberta i restaurada recentment, formés part d'aquest primitiu temple, a jutjar pel seu arc amb els muntats avançats.

El campanar de torre, també es creu que va ser aixecat en època romànica, si bé ja es tracta d'un element molt tardà. Destaquen les seves dues grans finestres del pis superior.

En la base de la torre, trobem la làpida sepulcral del sagristà Joan, que va morir l'any 1284 i llegà diversos bens al temple.

Un altre element romànic que es conserva en el temple és un timpà llis, del segle XII o XIII encastat en el mur de ponent, sobre la porta d'entrada.

L'església estava dins del recinte fortificat de Vilacolum, del que encara es conserva un portal, que cal travessar per accedir al temple.