En 1161 Berenguer de Rocacorba, la seva dona Flors i el seu fill Berenguer van cedir al bisbe de Girona, Guillem de Peratallada, l'església del seu castell. 

Durant el segle XIV es van fer algunes reformes, quan es van afegir els altars de Sant Salvador i de Santa Bàrbara. És en aquest segle que el castell comença a entrar en decadència. Ja en el segle XV es transforma l'església en un santuari marià.

L'església va ser destruïda en els terratrèmols del 1428. Anys més tard s'inicià la construcció d'una nova edificació, molt més petita, per a poder venerar la imatge de la Verge Maria.  Actualment es conserva una rèplica de la talla gòtica de la Mare de Déu de la Pera, una imatge d'alabastre policromada que es conserva en el Museu d'Art de Girona.

En el segle XVIII es modificà totalment el temple, dotant-lo d'una imatge similar a l'actual.

Adossada al temple es va construir una albergueria.

Del temple i del castell romànics no es conserva gaire cosa més que algunes filades de carreus, que s'aixecaven directament sobre la roca corba, una penya rocosa que dóna nom al indret de Rocacorba degut a la seva forma.